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第213章 计算生物学研究 四

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  徐辰指著屏幕上的一行参数,有些懊恼地说道:“我用的这个启动子,虽然理论强度是弱的,但在大肠桿菌的实际环境中,它会有一定的基础渗漏。也就是说,即使我不加诱导剂,它也会偷偷地表达一点点酶。”

  “而在我的模型里,我假设它是完美的开关。这就导致实际的酶活性比我计算的要高,反而触发了细胞的负反馈调节,把整个通路给锁死了。”

  徐辰在心里狠狠地吐槽了自己一句:这就是数学家的傲慢啊。总以为世界是完美的球体,结果现实却是个坑坑洼洼的土豆。生物系统里的噪音,有时候比信號还大。

  “那怎么办?重做?换个更严谨的启动子?”刘伟问道,手里已经准备去拿废液缸了。

  “不,不用重做。”徐辰抬手拦住了他,眼神中闪过一丝疯狂的数据流,“既然它喜欢渗漏,那我们就把渗漏也算进去。给我十分钟,我修正一下边界条件。”

  徐辰的手指在键盘上飞舞,屏幕上的代码如瀑布般流下。他並没有推翻模型,而是引入了一个“噪音项”,將那个不可控的渗漏表达量,强行纳入了微分方程的解空间。

  “既然关不紧水龙头,那就计算水滴漏下的频率,然后……利用它。”

  十分钟后,回车键敲响。一个新的数值跳了出来。

  “老刘,把诱导剂iptg的浓度,从0.1mm降到0.005mm。我们做一点『微调』,一点一点地把它的活性逼到那个临界点上。”

  “0.005mm?”刘伟瞪大了眼睛,差点以为自己听错了,“这也太低了吧?这跟没加有什么区別?这完全是顺势疗法的浓度啊!这能行吗?”

  “如果不信数学,我们还有別的选择吗?”徐辰反问道,目光灼灼,“如果不靠计算,让你凭经验去试,你会试0.005这个浓度吗?”

  刘伟愣了一下,摇摇头:“不会,正常人起码从0.05起跳。”

  “这就对了。”徐辰指了指脑袋,“生物系统的复杂性就在於它的非线性。那个能打开宝库的『芝麻开门』的频率,往往藏在人类直觉的盲区里。第一次我大意了,把地图画错了一角。现在地图修好了,除了跟著地图走,我们在黑暗中別无他法。”

  “相信数学。在混沌的生物系统里,它是唯一的火把。”

  ……

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